Prvním krokem k vytvoření zápočtu je výběr firmy, se kterou si chcete vzájemné pohledávky a závazky vyrovnat. Program následně otevře kartu zápočtu naplněnou neuhrazenými závazkovými a pohledávkovými doklady, které se vážou na vybraného partnera a odpovídají Nastavení zápočtů. Jednotlivé položky zápočtu mají doplněné jen hodnoty Zbývá uhradit, hodnoty K zápočtu jsou zatím nulové, zápočet je tak nevyrovnaný a jeho karta nejde uložit. Vyrovnání zápočtu můžete provést ručně doplněním hodnot K zápočtu na jednotlivých kartách tak, aby výsledný součet byl na obou stranách stejný, nebo můžete použít následující tlačítka k automatickému vyrovnání zápočtu.
V Průvodci nastavením programu si můžete zadat automatické sestavení návrhu vzájemného zápočtu s partnerem, který je uvedený na ukládané faktuře či závazkovém/pohledávkovém dokladu a má v agendě dosud neuhrazené pohledávky/závazky.
Doplnit optimální hodnoty – program vygeneruje zápočet jako součet nejvyšších možných částek určených k započtení a vyrovná tak obě strany zápočtu. Pokud je součet částek Zbývá uhradit na jedné straně nižší, program na druhé straně doplní částky K zápočtu jen do hodnoty tohoto součtu (jeden doklad se může započíst částečně, další doklady zůstanou nezapočtené). Doklady přitom program bere postupně podle toho, jak jsou v seznamu seřazené a jejich pořadí se dá ovlivnit změnou Třídění – doklady si můžete seřadit podle data splatnosti, podle výše částky k úhradě apod. Při doplnění optimální částky se zohledňují jak realizované úhrady vlastního dokladu, tak i vytvořené příkazy k úhradě či nerealizované zápočty. Pokud si tedy vytvoříte příkaz k úhradě (případně jiný, předcházející vzájemný zápočet) na částečnou úhradu daného dokladu, pak se optimální hodnota za tento doklad nastaví jen na zbývající částku, a to i v případě, kdy k vlastní úhradě vůbec nedošlo (příkaz k úhradě zatím nebyl bankou proveden, nebyl zpracován bankovní výpis s platbou, případně nebyl realizován předcházející vzájemný zápočet). Doplněné částky se dají také libovolně upravit.
Systém pracuje s vystavenými příkazy k úhradě. Pokud je tedy částečná úhrada provedena bez vystavení příkazu k úhradě (např. přímo v bankovním systému) a příkaz k úhradě vystavíte teprve následně, pak program vyhodnotí optimální hodnotu bez započtení této částečné úhrady. V takovém případě je třeba nastavenou částku ručně opravit na správnou výši.
Vynulovat hodnoty – jestliže jste na kartě provedli nějaké změny, které nechcete (např. vám nevyhovuje výpočet pomocí funkce Doplnit optimální hodnoty a chcete změnit třídění položek), tlačítkem všechny hodnoty vynulujete a můžete pokračovat v tvorbě zápočtu.
Cizí měny – slouží k nastavení kurzu pro zápočet v cizí měně.
Do výběru zahrnout všechny související firmy – zatrhnete-li tuto volbu, zahrnou se do zápočtu i všechny doklady vystavené pro firmy, které jsou vybrané firmě podřízené, případně její nadřízená firma a všechny další firmy této firmě podřízené.
Datum zápočtu – při dodatečné změně data na již uloženém zápočtu program nabídne přepočet kurzů cizích měn k nově vybranému datu. Můžete si přitom vybrat, zda chcete přepočítat částky v domácí, nebo cizí měně. Přepočet se uskuteční, když ve výběrovém okně použijete tlačítko Přepočítat, zavřete-li okno tlačítkem 
, k přepočtu nedojde.
Realizováno – pokud pole zatrhnete, program ihned vygeneruje příslušné interní doklady pro úhradu pohledávek a závazků a zápočet se považuje za realizovaný. Chcete-li si však návrh zápočtu nejprve nechat odsouhlasit partnerem, můžete jej uložit a realizovat v seznamu až později.
Firma – při prvním otevření karty je na obou stranách uvedený partner, kterého jste pro zápočet vybrali. Pokud chcete vytvořit trojstranný zápočet, můžete tlačítkem 
na kteroukoliv stranu vybrat jinou firmu, program doplní nové složení dokladů k započtení automaticky.
Opravit – otevřete kartu s rozpisem částek, na které můžete editovat částku K zápočtu.
Zobrazit doklad – tlačítkem otevřete zdrojový doklad položky v seznamu započtených pohledávek/závazků.
Smazat – doklady, které nechcete do zápočtu zahrnout, se tímto tlačítkem dají ze seznamu odstranit.